Njegov nadređeni je 15. juna najavio njegovo isključenje iz reda Družbe Isusove. Rupnik je prema kanonskim normama imao rok za žalbu do 14. jula, a kako to nije učinio i službeno je van reda. 

Katolička agencija pisala je i da su razni mediji objavili da će se slovenski svećenik preseliti u Hrvatsku, u Splitsko-makarsku nadbiskupiju.

Iz ureda Splitsko-makarske nadbiskupije to su danas demantirali kratkim saopćenjem. 

- Čitajući izvještaj iz neke štampe prošlih dana stječe se dojam kako Slovenac Marko Ivan Rupnik, o kome su mediji prošlih mjeseci puno pisali, "kani doseliti u Splitsko-makarsku nadbiskupiju". Na ured Splitsko-makarske nadbiskupije nije stizala nikakva molba, a ni preporuka u vezi sa slučajem Marka Ivana Rupnika. Stoga je nejasno temeljem čega je pojedina štampa objavila na svojim stranicama obavijest o "doseljenju" Marka Ivana Rupnika u Splitsko-makarsku nadbiskupiju - poručili su.